Chirurgické obory

• Anesteziologicko-resuscitační oddělení
• Gynekologické-porodnická klinika
• Chirurgická klinika
• Klinika plastické chirurgie
• Oční oddělení
• Oddělení dětské chirurgie
• Ortopedická klinika
• Otorinolaryngologické oddělení
• Protialkoholní záchytná stanice
• Urologické oddělení
• Zubní oddělení

Interní obory

• Dermatovenerologická klinka
• I.interní oddělení
• II.interní oddělení
• Infekční klinika
• Klinika pneumologie a hrudní chirurgie
• Neonatologické oddělení
• Neurologické oddělení
• Oddělení funkční diagnostiky a Centrum preventivní péče
• Oddělení fyziatrie a léčebné rehabilitace
• Oddělení léčby bolesti a centrum následné ošetřovatelské péče
• Pediatrické oddělení
• Ústav radiační onkologie

Komplement

• Oddělení klinické biochemie a imunologie
• Oddělení klinické farmacie
• Oddělení klinické hematologie a transfuze
• Oddělení klinické mikrobiologie
• Oddělení nutričních terapeutů
• Oddělení soudního lékařství
• Oddělení tropické medicíny
• Patologicko-anatomické oddělení
• Radiodiagnostická klinika

Ostatní obory

• Centrální sterilizace
• Lékárna
• Národní jednotka dohledu nad TBC
• Oddělení klinické psychologie
• Slatinné lázně Toušeň
• Sociálně-zdravotní oddělení
• Středisko vědeckých informací